行政部門:

| 辦公室 | 組織人事處（老干部工作辦公室）|
|黨群工作部（機關黨委、工會、團委）| 監察審計室 | 教務處 |
| 科研處 | 公務員培訓處 | 學員工作處 |研究生部 | 校院工作處 |
| 外事處 | 培訓處 | 決策咨詢部 | 信息化管理處 | 調研督查處 |
| 后勤保衛處 | 計劃財務處 | 校區運行協調辦公室 |
| 淀山湖校區管理辦公室 | 梅隴校區管理辦公室 |
| 上海市習近平新時代中國特色社會主義思想研究中心秘書處|

教研部門:

| 馬克思主義學院 | 哲學教研部（當代馬克思主義哲學研究所）|
| 經濟學教研部（理論經濟學研究所）| 科社教研部（當代社會主義研究所）|
| 中共黨史教研部 |黨的建設教研部（政黨研究所）|
| 公共管理教研部（政府研究所）| 社會學教研部（城市社會研究所） |
| 領導科學教研部（人力資源測評中心）|
|經濟管理教研部| 上海發展研究院 |